Amber

автор **кардинал** Пт Фев 12, 2010 11:33 pm

Amber("янтарь") означает две вещи: набор молекулярных механических силовых полей для моделирования биомолекул (которые находятся в общественном достоянии, и используется в различных программах моделирования), а также пакет программ молекулярного моделирования которая включает в себя исходный код и демо. Текущая версия Amber 10, которая распространяется по UCSF условия лицензионного соглашения, описанных ниже.

Amber теперь распространяется в двух частях: AmberTools и Amber10. Вы можете использовать AmberTools без Amber10, но не наоборот.
AmberTools 1.3
AmberTools состоит из нескольких независимо разработанных пакетов, которые хорошо работают сами по себе, и с Amber. Suite может быть также использована для проведения полного иcсследования в молекулярной физике (использование NAB), но имеются некоторые ограничения в газовой фазе . Новое в версии 1.3 являются: (а) параллельные вариации анализа траектории в ptraj; (б) программы квантовой химии .

AmberTools 1.3 состоит из пяти основных кодов, которые ранее были выпущены отдельно, и два новых:
NAB построение молекул, запускать MD
Создание силовых полей для органических молекул
ptraj -анализ траектории из Amber или CHARMM
tleap и xleap базовая программы для подготовки к симуляции Amber
sleap заменяет и расширяет tleap
программы квантовой химии
выполняет численное решение моделей Пуассона-Больцмана

Программы в основном выпущены под GNU General Public License (GPL). Включено несколько компонентов , которые находятся в государственной собственности, с открытым исходным кодом, лицензиями.
Вам понадобится C, C + + и Fortran90 компиляторы.

Размер: 90,3 МВ

Официальный сайт:[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]

Скачать(ссылка обновлена 23 октября 2013 г.) :

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]

автор Antontoni Пн Апр 26, 2010 2:13 am

Does not work Sad

Bad link.

автор **vella** Пн Апр 26, 2010 2:48 am

Excuse me,new links:

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]

references with official site

Amber

Amber

Re: Amber

Re: Amber