Вход
Поиск
Мой профиль
|
|
|
|
|
|
|
|
Мой профиль
Общение
Личные сообщения
Другое
Новое меню
Меню сайта
GAP (Geometric analysis programs)
Страница 1 из 1
GAP (Geometric analysis programs)
автор кардинал Чт Ноя 04, 2010 3:00 pm
GAP (Geometric analysis programs) был написан Garry Gippert .
GAP содержит два отдельных пакета для анализа структурных множеств.
Они используют общую объектную библиотеку.
GAP содержит набор программ используемых, чтобы анализировать структуры или семейства структур, обычно из базирующихся вычислений NMR.
Каждая программа анализа выполняет единственную геометрическую задачу:
ANGLES- Вычисляет углы кручения
AVESTR -Вычисляет геометрическую структуру.
DISCOM Вычисляет averate и матрицы различия в расстояниях RMS между соответствующими атомами в двух структурных семействах.
DISTANCE - Вычисляет среднее число и rms расстояния, включает усреднение rm6 или итог эквиалентных протонов (может интерпретировать номенклатуру псевдо-атома).
HBONDS- Вычисляет водородные bonds.
NOEVIO - Вычисляет нарушения ограничения расстояния NOE.
TORVIO- Вычисляет угол нарушений кручения TORVIO
SUPER - Накладывает структуры на другое.
POSER Precision-weighted ensemble superposition
EMPOSER Multiple ensemble precision-weighted superposition.
RMSCOM Compute average pairwise rms/residue within and between two structure familes.
Пакет DTAGS содержит набор программ используемых, чтобы выполнять сетку угла систематического поиска кручения полипептида и polynucleotides структур, и, чтобы анализировать свойства результирующего множества структур.
reslib подготавливать вклад к поиску из первичной библиотеки последовательности и остатка
dtags согласовывает поиск сетки в пространстве для расстояния между линейными подмолекулами.
newmol двоичный поиск search в Декартовом пространстве для произвольных отраслевых молекул.
srchvec начальное кручение векторного пространства для newmol
launch (сценарий/оболочка nawk программы), подготавливает выполнение сценария к крупномасштабному двоичному поиску search
spacecat "connecting" elements of binary tree search
genave выдача newmol вклада для генерации среднего числа расстояния и extremama матриц, и для вложения средней структуры расстояния.
genall выдача newmol вклада для генерации всех структур в среднюю структуру.
gengeo выдача newmol вклада, чтобы анализировать геометрические свойства структур
Официальный сайт: [Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]
Размер:2,15 Мв
Скачать:
[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]
GAP содержит два отдельных пакета для анализа структурных множеств.
Они используют общую объектную библиотеку.
GAP содержит набор программ используемых, чтобы анализировать структуры или семейства структур, обычно из базирующихся вычислений NMR.
Каждая программа анализа выполняет единственную геометрическую задачу:
ANGLES- Вычисляет углы кручения
AVESTR -Вычисляет геометрическую структуру.
DISCOM Вычисляет averate и матрицы различия в расстояниях RMS между соответствующими атомами в двух структурных семействах.
DISTANCE - Вычисляет среднее число и rms расстояния, включает усреднение rm6 или итог эквиалентных протонов (может интерпретировать номенклатуру псевдо-атома).
HBONDS- Вычисляет водородные bonds.
NOEVIO - Вычисляет нарушения ограничения расстояния NOE.
TORVIO- Вычисляет угол нарушений кручения TORVIO
SUPER - Накладывает структуры на другое.
POSER Precision-weighted ensemble superposition
EMPOSER Multiple ensemble precision-weighted superposition.
RMSCOM Compute average pairwise rms/residue within and between two structure familes.
Пакет DTAGS содержит набор программ используемых, чтобы выполнять сетку угла систематического поиска кручения полипептида и polynucleotides структур, и, чтобы анализировать свойства результирующего множества структур.
reslib подготавливать вклад к поиску из первичной библиотеки последовательности и остатка
dtags согласовывает поиск сетки в пространстве для расстояния между линейными подмолекулами.
newmol двоичный поиск search в Декартовом пространстве для произвольных отраслевых молекул.
srchvec начальное кручение векторного пространства для newmol
launch (сценарий/оболочка nawk программы), подготавливает выполнение сценария к крупномасштабному двоичному поиску search
spacecat "connecting" elements of binary tree search
genave выдача newmol вклада для генерации среднего числа расстояния и extremama матриц, и для вложения средней структуры расстояния.
genall выдача newmol вклада для генерации всех структур в среднюю структуру.
gengeo выдача newmol вклада, чтобы анализировать геометрические свойства структур
Официальный сайт: [Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]
Размер:2,15 Мв
Скачать:
[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]
кардинал- Модератор
- Сообщения : 1920
Дата регистрации : 2009-08-10
Место жительства : Из далека...
Страница 1 из 1
Права доступа к этому форуму:
Вы не можете отвечать на сообщения
» Программа Изоляция
» Помогите найти программу!
» Чертков И.Н. и др.Самодельные демонстрационные приборы по химии
» М.Склодовская-Кюри.Радій и радіактивность
» Урбанский Т.и др.Пиротехника. Сборник книг (1956-2011)
» HyperChem
» мочевина
» Централизованное тестирование. Химия. Полный сборник тестов.2006-2013 года
» Авторская программа Соболевой А.Д.Химический лицей.Семинары по органической химии.Тесты заданий.11 класс
» Склодовская-Кюри М." Изслъедованія надъ радіоактивными веществами"
» Гемпель К.А. Справочник по редким металлам
» Т.К. Веселовская и др. "Вопросы и задачи по органической химии" под ред.:Н.Н.Суворова
» Оржековский П.А.и др.ЕГЭ 2015, Химия, Сборник заданий
» XPowder
» Формулы Периодического Закона химических элементов
» Macromedia Flash 8-полный видеокурс
» Ищу "Химический тренажер" Нентвиг, Кройдер, Моргенштерн Москва, Мир, 1986
» Штремплер Г.И.Часть 6. Тесты. Химические реакции
» Пак Е.П.Проверочные работы по химии 8 класс
» Сказка "Король «Бензол»"
» ПОМОГИТЕ С РЕАКЦИЕЙ, ПОЖАЛУЙСТА
» помогите определить вещество
» The Elements Spectra 1.0.6 - Русская версия
» Строение вещества
» Лурье Ю.Ю. - Справочник по аналитической химии
» Видеоурок по химии.Мыло и моющие вещества
» задача
» превращения веществ
» Задачка по химии
» Генрих Штремплер.Видео "Учебный эксперимент по химии"
» Генрих Штремплер.Видео "Учебный эксперимент по химии"
» Нижник Я.П.Лекция 11 "Альдегиды и кетоны"
» Нижник Я.П. Лекция №4: "Непредельные углеводороды.Алкены"
» Нижник Я.П.Лекция 5 .Алкадиены и алкины
» Нижник Я.П.Лекция 7. Арены-ароматические углеводороды
» Нижник Я.П.Лекция 8:"Галогенпроизводные углеводородов"
» Нижник Я.П.Лекция 9:"Спирты"
» Нижник Я.П.Лекция 10 :"Фенолы.Простые эфиры"
» Нижник Я.П. Лекция №3 "Углеводороды.Алканы"
» Нижник Я.П.Лекция 6.Циклические соединения
» Строение атома.
» превращения веществ
» Хочу найти ответ на свой вопрос в старых темах
» "Интеграл" серия - "Эколог"
» Академия занимательных наук.Химия(часть 47).Химический источник тока. Процесс электролиза.
» Научный проект:"Радуга химических реакций"
» Онлайн калькулятор определения степеней оксиления элементов в соединение
» MarvinSketch 5.1.3.2
» Carlson.Civil.Suite.2017.160728