EMBOSS

EMBOSS "Европейская молекулярная биология открытый набор программного обеспечения".
EMBOSS свободный общедоступный аналитический пакет программного обеспечения, особенно развитый для потребностей молекулярной биологии (например. EMBnet) пользовательского сообщества.
EMBOSS также объединяет диапазон в настоящее время доступных пакетов и инструментов для анализа последовательности в целом без шва.
EMBOSS главные особенности:

Должным образом построенный набор инструментов для того, чтобы создать здравые приложения биоинформатики или технологические процессы.
Исчерпывающий набор аналитических программ последовательности.
Обширная программная библиотека для общих аналитических задач последовательности.
Дополнительные программные библиотеки для многих других областей включая обработку последовательности, соответствие образца, обработку списка и индексацию базы данных.
Программа бесплатна.
Это - общедоступный проект.

В пределах EMBOSS у Вас приблизительно сотни программ , касающиеся областей, таких как:
Выравнивание последовательности,
Быстрая база данных, ищущая  образцы последовательности,
Идентификация  белков
Анализ образца последовательности нуклеотида
Анализ использования кодона для маленьких геномов,
Быстрая идентификация образцов последовательности в крупномасштабных наборах последовательности,
Инструменты представления для публикации,и многое другое.

Популярные приложения включают:
prophet Выравнивание Gapped для профилей.
infoseq Показ некоторой простой информации о последовательностях.
water              Smith-Waterman местное выравнивание.
pepstats Статистика белка.
showfeat Покажит особенности последовательности.
palindrome Ищет перевёрнутые повторения в последовательности нуклеотида.
eprimer3 Выборы учебников для начинающих PCR и скрещивание oligos.
profit            Просмотрите последовательность или базу данных с матрицей или профилем.
extractseq Области извлечения из последовательности.
marscan Находит места МАРТЕ/SAR в нуклеиновых последовательностях.
tfscan            Последовательности ДНК просмотров для транскрипционных факторов.
patmatmotifs Сравнивает последовательность белка с базой данных  PROSITE.
showdb Информация о показах в настоящее время доступных  для базы данных.
wossname Finds programs by keywords in their one-line documentation.
abiview Читает файл ABI, и покажит след.
tranalign Выровняйте нуклеиновые кодирующие области

Официальный сайт: [Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]

Размер:22,5 Мв

Скачать EMBOSS-6.3.1(ссылка обновлена 21 октября 2013 г.):

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]